Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC9Q9Y3B6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EMC9Q9Y3B6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMC9Q9Y3B6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC9Q9Y3B6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms