Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
TRAPPC8Q9Y2L5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
TRAPPC8Q9Y2L5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms