Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HPS5Q9UPZ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HPS5Q9UPZ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HPS5Q9UPZ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HPS5Q9UPZ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HPS5Q9UPZ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HPS5Q9UPZ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.2 ms