Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR3Q9UNL2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR3Q9UNL2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSR3Q9UNL2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSR3Q9UNL2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSR3Q9UNL2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSR3Q9UNL2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSR3Q9UNL2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR3Q9UNL2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSR3Q9UNL2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms