Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB23Q9ULC3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB23Q9ULC3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187 ms