Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC42EP3Q9UKI2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms