Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TNIKQ9UKE5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
TNIKQ9UKE5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
TNIKQ9UKE5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.51■■■■■ 4.08
TNIKQ9UKE5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TNIKQ9UKE5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms