Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXW11Q9UKB1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXW11Q9UKB1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXW11Q9UKB1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXW11Q9UKB1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXW11Q9UKB1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FBXW11Q9UKB1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXW11Q9UKB1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXW11Q9UKB1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXW11Q9UKB1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms