Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF11Q9UIL8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF11Q9UIL8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF11Q9UIL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF11Q9UIL8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms