Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN4Q9UHM6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OPN4Q9UHM6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPN4Q9UHM6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms