Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX20Q9UHI6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX20Q9UHI6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
DDX20Q9UHI6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX20Q9UHI6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms