Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNTNAP2Q9UHC6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP2Q9UHC6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTNAP2Q9UHC6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms