Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXTL2Q9UBQ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL2Q9UBQ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EXTL2Q9UBQ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms