Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2S2

NRXN2, Neurexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN2Q9P2S2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN2Q9P2S2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NRXN2Q9P2S2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NRXN2Q9P2S2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NRXN2Q9P2S2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NRXN2Q9P2S2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NRXN2Q9P2S2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NRXN2Q9P2S2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NRXN2Q9P2S2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NRXN2Q9P2S2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NRXN2Q9P2S2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NRXN2Q9P2S2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms