Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL9Q9P2J3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms