Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CHPF2Q9P2E5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CHPF2Q9P2E5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHPF2Q9P2E5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CHPF2Q9P2E5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHPF2Q9P2E5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHPF2Q9P2E5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHPF2Q9P2E5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHPF2Q9P2E5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CHPF2Q9P2E5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHPF2Q9P2E5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHPF2Q9P2E5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHPF2Q9P2E5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHPF2Q9P2E5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CHPF2Q9P2E5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms