Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR3BQ9P1U1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTR3BQ9P1U1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR3BQ9P1U1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTR3BQ9P1U1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms