Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRD1Q9P1U0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNRD1Q9P1U0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNRD1Q9P1U0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms