Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms