Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS2Q9NYR9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS2Q9NYR9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms