Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX43Q9NXZ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX43Q9NXZ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX43Q9NXZ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX43Q9NXZ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDX43Q9NXZ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms