Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM9Q9NXL9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MCM9Q9NXL9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms