Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM160Q9NX00 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM160Q9NX00 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM160Q9NX00 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms