Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SLC52A1Q9NWF4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
SLC52A1Q9NWF4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SLC52A1Q9NWF4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SLC52A1Q9NWF4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SLC52A1Q9NWF4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SLC52A1Q9NWF4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SLC52A1Q9NWF4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SLC52A1Q9NWF4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SLC52A1Q9NWF4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SLC52A1Q9NWF4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms