Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00846Q9NV44 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00846Q9NV44 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms