Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCM2LQ9NUG4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCM2LQ9NUG4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCM2LQ9NUG4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCM2LQ9NUG4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms