Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAR1AQ9NR31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAR1AQ9NR31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SAR1AQ9NR31 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAR1AQ9NR31 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAR1AQ9NR31 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAR1AQ9NR31 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAR1AQ9NR31 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms