Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGB3Q9NQW8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB3Q9NQW8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB3Q9NQW8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB3Q9NQW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB3Q9NQW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGB3Q9NQW8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB3Q9NQW8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGB3Q9NQW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB3Q9NQW8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB3Q9NQW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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