Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRCC1Q9NPI7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRCC1Q9NPI7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRCC1Q9NPI7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRCC1Q9NPI7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms