Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZCCHC17Q9NP64 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZCCHC17Q9NP64 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZCCHC17Q9NP64 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZCCHC17Q9NP64 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms