Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VCX3AQ9NNX9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCX3AQ9NNX9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VCX3AQ9NNX9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms