Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP110Q9HB58 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SP110Q9HB58 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP110Q9HB58 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 486 ms