Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMURF2Q9HAU4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SMURF2Q9HAU4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMURF2Q9HAU4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMURF2Q9HAU4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms