Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HIPK3Q9H422 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIPK3Q9H422 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIPK3Q9H422 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HIPK3Q9H422 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms