Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRMDAQ9H2I8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRMDAQ9H2I8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRMDAQ9H2I8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms