Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ZC3H12CQ9C0D7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZC3H12CQ9C0D7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZC3H12CQ9C0D7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ZC3H12CQ9C0D7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZC3H12CQ9C0D7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms