Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCLK3Q9C098 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCLK3Q9C098 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLK3Q9C098 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms