Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BARHL1Q9BZE3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARHL1Q9BZE3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARHL1Q9BZE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARHL1Q9BZE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARHL1Q9BZE3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARHL1Q9BZE3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARHL1Q9BZE3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARHL1Q9BZE3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARHL1Q9BZE3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARHL1Q9BZE3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARHL1Q9BZE3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BARHL1Q9BZE3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARHL1Q9BZE3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms