Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SALL3Q9BXA9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SALL3Q9BXA9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SALL3Q9BXA9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SALL3Q9BXA9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms