Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC106Q9BWC9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC106Q9BWC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC106Q9BWC9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.1 ms