Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC11Q9BVV2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC11Q9BVV2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC11Q9BVV2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1608.8 ms