Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MXRA8Q9BRK3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MXRA8Q9BRK3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MXRA8Q9BRK3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MXRA8Q9BRK3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms