Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPN18Q99952 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN18Q99952 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN18Q99952 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN18Q99952 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms