Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD5Q99717 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD5Q99717 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD5Q99717 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms