Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PIK3R4Q99570 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PIK3R4Q99570 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PIK3R4Q99570 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PIK3R4Q99570 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PIK3R4Q99570 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PIK3R4Q99570 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms