Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT8L2Q96SF2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT8L2Q96SF2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT8L2Q96SF2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT8L2Q96SF2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT8L2Q96SF2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT8L2Q96SF2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT8L2Q96SF2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT8L2Q96SF2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT8L2Q96SF2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8L2Q96SF2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8L2Q96SF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms