Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INPP4AQ96PE3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INPP4AQ96PE3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INPP4AQ96PE3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 519.3 ms