Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPNS2Q96L46 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CAPNS2Q96L46 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPNS2Q96L46 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms