Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCMH1Q96GD3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCMH1Q96GD3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms