Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINGO1Q96FE5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO1Q96FE5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINGO1Q96FE5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms