Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SIRT1Q96EB6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SIRT1Q96EB6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SIRT1Q96EB6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SIRT1Q96EB6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms